Plusieurs campagnes de fouilles réalisées à Dendérah, celle de Fliders Pétrie datant de la fin du XIXème siècle notamment, révélèrent l'existence de diverses sépultures, datées pour certaines de l'époque archaïque. La relative proximité des sites prédynastiques de Nagada et Maghara milite elle aussi en faveur de la haute antiquité de ce lieu, de son occupation, dès l'aube de l'histoire égyptienne. Une occupation qui semble bien n'avoir jamais failli, tout au long de l'Epoque Dynastique. En témoigne la découverte d'une statuette du roi Pépi Ier (vers 2270 avant notre ère) et d'un sistre, emblème de la ville, inscrit à son nom. En témoigne la réutilisation, à des fins d'acheminement d'eau, d'une colonne portant le nom d'Amenhemat, l'un des souverains du Moyen Empire. En témoigne ce texte hiéroglyphique stipulant l'intervention à Dendérah de ce grand bâtisseur du Nouvel Empire qu'était le pharaon Touthmosis III (vers 1450 avant J.C.). En témoignent ces blocs de pierre de facture ramesside visibles dans les soubassements, ...

De nombreux autres indices architecturaux laissent à penser que l'édification du temple de la naissance d'Isis, sous le règne d'Auguste (30 avant notre ère - 14 de notre ère), s'opéra sur les fondations même d'un sanctuaire entrepris, à l'époque ptolémaïque, par Nectanébo Ier (381-364 avant notre ère), et achevé par Ptolémée X Alexandre Ier (107-88 avant notre ère) - sanctuaire dont l'axe principal présente une orientation est-ouest. L'édifice augustéen, d'époque romaine donc, révèle quant à lui une orientation nord-sud, strictement identique à celle du grand temple d'Hathor, et, fait étrange, non perpendiculaire à l'axe est-ouest primordial. L'angle formé entre l'ancien mur de Nectanébo Ier et la paroi orientale de l'actuel temple d'Isis est voisin de 2°30' en effet.

L'angle alpha matérialise le changement d'orientation intervenu
dans l'axe principal du temple d'Isis, à l'époque romaine.